如何选择流式抗体，我们建议您从以下六个方面进行考虑：

1. 满足抗体选择的基本条件
靶蛋白特异性：确定目的细胞的特异性表面标记或者胞内标记，清楚您要检测什么。
种属：严格按照待测样本种属选择抗体来源，流式抗体基本无种属间交叉反应。
应用领域：可用于流式实验，说明书中明确标注经FC实验测试，最好有实验数据图和用量说明。
抗体克隆号：一般选择参考文献上提到的克隆；同一抗体多个克隆号的情况下，可以选择荧光标记种类最多的那个克隆。

2. 确定流式细胞仪的参数配置
在设计流式检测方案前，根据可能需要同时检测指标的数量，先确定流式细胞仪的型号，对该仪器的参数配置，要了解以下几个方面的信息：
激光器：常见的流式细胞仪有488 nm和633 nm两个激光器，但有些机器在购买时因某些原因，只装了一个488 nm激光器，所以需要注意型号相同的机器也未必激光配置相同。
滤光片：也就是有几个检测通道，这决定了你最多可以同时检测几个指标。
仪器的具体型号：有助于再次确定检测通道。因为同一个荧光在不同的流式细胞仪上检测，有时候检测通道也是不一样的。

3. 荧光的选择建议
直标还是间标：待测抗原表达丰度高的尽量选择直标抗体，待测抗原表达丰度低的需要考虑选生物素标记抗体。
荧光强弱： 荧光本身有强弱之分，可视抗原表达强弱及分群情况选择合适的荧光。如抗原表达丰度弱或分群不明显的建议选择强荧光,例如：PE、APC；反之，抗原表达丰度强或分群明显的建议选择最常用的弱荧光,例如FITC即可（常用荧光强弱程度排序为：PE>APC>PE/Cy5>PerCP/Cy5.5>FITC）。
类似荧光的权衡：可以尝试选择新型荧光Alexa Fluor、eFluor等。因为这些荧光非常明亮，对激光稳定性好，对PH 值不敏感，具有水溶性（如Alexa Fluor488与FITC检测通道相同，但是荧光强度和光敏感上，前者明显优于后者）。

4. 多色荧光搭配的原则
多色分析方案中荧光抗体的选择和搭配，会受到很多因素的制约，是个难点。
检测通道不能冲突：每个检测通道只能选择1种荧光素，各通道之间的荧光素可以随意搭配（如FL1选择了FITC标记的抗体，就不能再选择Alexa Fluor488标记的抗体；而同组实验的其余抗体选择PE或者APC标记，都可以随意组合）。
荧光强弱：所选各种荧光素光谱的重叠应当尽量减少，否则将会导致较大的补偿。例如，PE/Cy5与APC同时标记，将会导致补偿过度，需换成PE/Cy5.5或PerCP/Cy5.5。最常用的荧光搭配是：FITC、PE、PerCP、PerCP/Cy5.5、APC。
多色荧光搭配：多色分析往往会因个别抗体荧光素种类极少而受到限制，需要同时参考多家抗体公司的产品进行方案设计。因此如遇5色以上分析需求，建议咨询三箭生物技术支持。

5. 抗体使用剂量
同一个产品通常会提供多个规格供您选购，可以根据实验的具体样本量和说明书建议用量来确定抗体用量：
细胞数：通常情况下流式检测一次的样本量为10^6~10^8个细胞，建议对样本做细胞计数，以保证抗体标记效果最佳；
包装：以test为计量单位的抗体，按照每test细胞悬液体积计算出每次加入多少体积抗体即可； 以ug为计量单位的抗体，需要根据说明书计算出每次加入多少体积的抗体。

6. 同型对照抗体的选择
同型对照（Isotype Control），是用于消除由于抗体非特异性结合到细胞表面而产生的背景染色，是真正意义上的流式阴性对照，流式细胞实验不可或缺的一项。
来源：同型对照是使用与一抗相同种属来源、相同亚型及亚链、相同荧光标记的免疫球蛋白，也要求使用相同剂量。同型对照一定要选择准确，通常在荧光一抗的说明书中，厂家会给出同型对照抗体的货号；
纯化级别抗体：如果是纯化的一抗加荧光标记的二抗，那么应该选择与一抗相对应的同型对照抗体（如样品管为：纯化的CD3+PE标记的二抗+样本；则对照管为：纯化的同型对照+ PE标记的二抗+样本）。